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科研合作成果發(fā)表，生物多組學數(shù)據(jù)整合分析助力醫(yī)學研究
2024-05-20
多組學數(shù)據(jù)挖掘在靶點發(fā)現(xiàn)中發(fā)揮著至關重要的作用。通過整合基因組學、轉錄組學、蛋白質組學、代謝組學等多個組學層面的數(shù)據(jù)，研究人員可以更全面地理解生物體內分子的相互作用和調控網絡。這種綜合分析有助于揭示疾病的發(fā)生機制、識別潛在的診斷和治療靶點。近期，熱景生物信息中心在組學數(shù)據(jù)研究上有兩篇成果發(fā)表。

01.《Frontiers in Microbiology》（《微生物學前沿》）

“The impact of antibiotic exposure on antibiotic resistance gene dynamics in the gut microbiota of inflammatory bowel disease patients”發(fā)表于Frontiers in Microbiology (DOI:10.3389/fmicb.2024.1382332)。該研究基于宏基因組數(shù)據(jù)搭建了腸道菌群耐藥性的分析方法，探究了耐藥基因在腸道菌群中的傳播路徑。

該研究通過分析抗生素使用前后的腸道菌群狀態(tài)，發(fā)現(xiàn)暴露于抗生素可以誘導IBD患者腸道微生物群組成的改變，特別是益生菌的減少，在停止抗生素后逐漸恢復到新的穩(wěn)定狀態(tài)。并通過網絡分析揭示了耐藥基因的傾向于在分類學上接近的生物體之間轉移。停止使用抗生素后，特異性耐藥基因的流行率和種間流動性增加。

02.《Frontiers in Genetics》（《遺傳學前沿》）

“In search of the ratio of miRNA expression as robust biomarkers for constructing stable diagnostic models among multi-center data”發(fā)表在Frontiers in Genetics上(DOI:10.3389/fgene.2024.1381917)。該研究開發(fā)了一類生物標志物形式，能夠在多中心數(shù)據(jù)中表現(xiàn)穩(wěn)健。

該研究基于轉錄因子介導的miRNA-miRNA相互作用網絡，構建以miRNA對的表達比率作為樣本特征的標志物篩選方法，用于建立輔助疾病診斷的風險評分模型。該方法在多個多中心數(shù)據(jù)集中表現(xiàn)優(yōu)越，可以準確的用于疾病早期診斷。

生信中心為搭建多組學分析平臺發(fā)表的兩篇文章受到了審稿人和讀者的廣泛關注。這些研究成果為深入探索生物體系的復雜性和發(fā)現(xiàn)新的生物標志物提供了重要的理論和方法支持。
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